FASTA

用 header 和序列行表示核酸或蛋白序列的基础文本格式。Basic text format for nucleotide or protein sequences.

常见用途 | Common Uses

• 参考基因组、转录本、蛋白序列。
• 比对索引构建。
• 序列提取、统计和格式转换。

关键点 | Notes

• header 行以 > 开头。
• 序列可以换行，也可以线性化成单行。
• 参考 FASTA 常配套 .fai、dict、aligner index 等文件。

示例 | Example

>chr1
ACGTACGTACGT

参考 | References

• NCBI FASTA format: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/fastaformat/