基于单拷贝直系同源基因集评估基因组、转录组或蛋白集完整性的工具。Completeness assessment using lineage-specific single-copy orthologs.
mamba install -c bioconda busco
基因组模式：
busco -i assembly.fasta -m genome \
-l bacteria_odb10 -o sample_busco -c 8
蛋白模式：
busco -i proteins.faa -m proteins \
-l eukaryota_odb10 -o proteins_busco -c 8
自动选择 lineage：
busco -i assembly.fasta -m genome \
--auto-lineage -o auto_busco -c 8
-i：输入 FASTA。-m：模式，genome, transcriptome, proteins。-l：lineage dataset。--auto-lineage：自动选择 lineage。-o：输出名称。-c：线程数。