GTF

常用于 RNA-seq 的基因注释格式，描述 gene、transcript、exon 等 feature。Gene annotation format widely used in RNA-seq workflows.

常见用途 | Common Uses

• STAR genome index 构建。
• featureCounts read counting。
• transcript-to-gene mapping。

关键点 | Notes

• GTF 是 GFF2 的约定化变体。
• 第九列常含 gene_id、transcript_id 等属性。
• 坐标通常为 1-based inclusive。

参考 | References

• GENCODE format guide: https://www.gencodegenes.org/pages/data_format.html