SAF

featureCounts 支持的简化注释格式，用少量列描述可计数 feature。Simplified annotation format supported by featureCounts.

常见用途 | Common Uses

• 自定义 target/read counting 注释。
• 不方便使用 GTF/GFF 时的 featureCounts 输入。
• panel、peak、custom region 计数。

关键点 | Notes

• 常见列为 GeneID, Chr, Start, End, Strand。
• 坐标语义按 featureCounts 文档执行。
• 比 GTF 更简单，但生物学层级信息更少。

参考 | References

• Subread user guide: https://subread.sourceforge.net/SubreadUsersGuide.pdf