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BEDPE
用于表示成对基因组区间的 BED 扩展格式，常见于 paired-end peak calling 和结构变异。BED extension for paired genomic intervals.
常见用途 | Common Uses
- ATAC-seq/ChIP-seq paired-end fragment 表示。
- 结构变异 breakend 或 breakpoint pair。
- MACS3
BAMPE/fragment 类分析的相邻概念。
关键点 | Notes
- 前六列描述两个区间：
chrom1 start1 end1 chrom2 start2 end2。
- 坐标语义延续 BED 的 0-based half-open。
- 不同工具对后续列含义可能不同。
参考 | References