BCF

VCF 的二进制形式，适合高效存储和处理大规模变异数据。Binary representation of VCF for efficient storage and processing of variant data.

常见用途 | Common Uses

• 大样本队列变异处理。
• bcftools 流程中的中间格式。
• 高效过滤、合并、查询 genotype 数据。

关键点 | Notes

• 人类可读性不如 VCF，但速度和体积更适合大规模分析。
• 通常用 bcftools view -Ob 输出 BCF。
• 仍需索引才能高效区域访问。

常用工具 | Tools

bcftools view -Ob input.vcf.gz -o output.bcf
bcftools index output.bcf

参考 | References

• VCF/BCF specification: https://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.3.pdf